دانلود کتاب Biological modeling and simulation: A survey of practical models, algorithms, and numerical methods

ترجمه فارسی توضیحات (ترجمه ماشینی)

مدل‌سازی و شبیه‌سازی بیولوژیکی: بررسی مدل‌های عملی، الگوریتم‌ها و روش‌های عددی

در حال حاضر منابع زیست شناسی محاسباتی بسیار خوبی برای یادگیری در مورد روش هایی وجود دارد که برای پرداختن به سیستم های بیولوژیکی خاص توسعه یافته اند، اما توجه نسبتاً کمی به آموزش زیست شناسان محاسباتی مشتاق برای رسیدگی به مشکلات جدید و پیش بینی نشده شده است. این متن قصد دارد با آموزش دانش‌آموزان درباره ایجاد مدل‌های ریاضی رسمی سیستم‌های بیولوژیکی که قابل تجزیه و تحلیل محاسباتی هستند، این شکاف را پر کند. مجموعه‌ای از مدل‌ها، الگوریتم‌ها و ابزارهای تحلیل نظری که معمولاً در میان بسیاری از رشته‌های دیگر پراکنده هستند را در یک مکان جمع‌آوری می‌کند. به این ترتیب ابزار studentshte در اختیار آنها قرار می‌گیرد که به خوبی در مدل‌سازی مسائل برگرفته از زیرشاخه‌های متعدد زیست‌شناسی به آنها کمک می‌کند. این تکنیک‌ها از منظر آنچه پزشک برای استفاده مؤثر از آنها باید بداند، آموزش داده می‌شود، همراه با منابعی برای مطالعه بیشتر در مورد استفاده پیشرفته‌تر از هر روش تحت پوشش. متن مدل‌هایی را برای بهینه‌سازی، شبیه‌سازی و نمونه‌برداری و تنظیم پارامترها پوشش می‌دهد. این موضوعات یک چارچوب کلی برای یادگیری نحوه فرمول‌بندی مدل‌های ریاضی سیستم‌های بیولوژیکی، چه تکنیک‌هایی برای کار با این مدل‌ها و نحوه تطبیق مدل‌ها با سیستم‌های خاص ارائه می‌کنند. کاربرد آنها با مثال‌های زیادی که از رشته‌های مختلف زیست‌شناسی و چندین مطالعه موردی گسترده گرفته شده است نشان داده می‌شود که نشان می‌دهد چگونه روش‌های توصیف‌شده برای مشکلات واقعی زیست‌شناسی به کار گرفته شده‌اند.

Biological modeling and simulation: A survey of practical models, algorithms, and numerical methods

There are many excellent computational biology resources now available for learning about methods that have been developed to address specific biological systems, but comparatively little attention has been paid to training aspiring computational biologists to handle new and unanticipated problems. This text is intended to fill that gap by teaching students how to reason about developing formal mathematical models of biological systems that are amenable to computational analysis. It collects in one place a selection of broadly useful models, algorithms, and theoretical analysis tools normally found scattered among many other disciplines. It thereby gives studentshte tools that will serve them well in modeling problems drawn from numerous subfields of biology. These techniques are taught from the perspective of what the practitioner needs to know to use them effectively, supplemented with references for further reading on more advanced use of each method covered. The text covers models for optimization, simulation and sampling, and parameter tuning. These topics provide a general framework for learning how to formulate mathematical models of biological systems, what techniques are available to work with these models, and how to fit the models to particular systems. Their application is illustrated by many examples drawn from a variety of biological disciplines and several extended case studies that show how the methods described have been applied to real problems in biology.