دانلود کتاب Mastering Perl for Bioinformatics

ترجمه فارسی توضیحات (ترجمه ماشینی)

تسلط بر پرل برای بیوانفورماتیک

از لحاظ تاریخی، برنامه نویسی به عنوان یک مهارت حیاتی برای زیست شناسان در نظر گرفته نشده است. اما اکنون، با دسترسی به حجم وسیعی از داده‌های بیولوژیکی موجود در پایگاه‌های اطلاعاتی عمومی، مهارت‌های برنامه‌نویسی به طور فزاینده‌ای در تحقیق و توسعه زیست‌شناسی مورد تقاضا هستند. Perl با ظرفیت های بسیار توسعه یافته خود در مدیریت رشته، پردازش متن، شبکه سازی و نمونه سازی سریع، به عنوان زبان برنامه نویسی انتخابی برای تجزیه و تحلیل داده های بیولوژیکی ظاهر شده است. تسلط بر پرل برای بیوانفورماتیک زبان اصلی پرل و بسیاری از پسوندهای ماژول آن را پوشش می دهد و آنها را در زمینه داده های بیولوژیکی و مشکلات مورد علاقه جامعه بیولوژیکی ارائه می دهد. این کتاب به همراه Beginning Perl برای بیوانفورماتیک، یک دوره پایه در برنامه نویسی Perl را تشکیل می دهد. این جلد دوم مطالب آموزشی پایه پرل (مراجعات، ساختارهای داده پیچیده، برنامه نویسی شی گرا، استفاده از ماژول ها – همه در یک زمینه بیولوژیکی ارائه شده) را به پایان می رساند و برخی از موضوعات پیشرفته با علاقه قابل توجه در بیوانفورماتیک را ارائه می دهد. طیف وسیعی از موضوعات تحت پوشش در Mastering Perl برای بیوانفورماتیک خواننده را برای پیشرفت‌های پایدار و نوظهور در زمینه‌های حیاتی برنامه‌نویسی بیوانفورماتیک آماده می‌کند: * ژن یابی * همترازی رشته * روش‌های ذخیره و بازیابی داده‌ها (SML و پایگاه‌های داده) * مدل‌سازی شبکه‌ها نمودارها و شبکه های پتری) * گرافیک (Tk) * موازی سازی * ارتباط با سایر زبان های برنامه نویسی * آمار (PDL) * تعیین ساختار پروتئین * مدل های بیولوژیکی محاسبات (کامپیوترهای DNA) زیست شناسان و دانشمندان کامپیوتری که اصول اولیه پرل را فتح کرده اند و آماده هستند. حتی پیشروی در تسلط خود بر این زبان همه کاره، از رویکرد متعادل نویسنده در به کارگیری توانایی های تحلیلی پرل در زمینه بیوانفورماتیک قدردانی خواهد کرد. این کتاب پر از مثال‌های عملی و حل مسائل بیولوژیکی در دنیای واقعی، برای هر خواننده‌ای که می‌خواهد فراتر از سطح مبتدی Perl در بیوانفورماتیک حرکت کند، ضروری است.

Mastering Perl for Bioinformatics

Historically, programming hasn’t been considered a critical skill for biologists. But now, with access to vast amounts of biological data contained in public databases, programming skills are increasingly in strong demand in biology research and development. Perl, with its highly developed capacities in string handling, text processing, networking, and rapid prototyping, has emerged as the programming language of choice for biological data analysis. Mastering Perl for Bioinformatics covers the core Perl language and many of its module extensions, presenting them in the context of biological data and problems of pressing interest to the biological community. This book, along with Beginning Perl for Bioinformatics, forms a basic course in Perl programming. This second volume finishes the basic Perl tutorial material (references, complex data structures, object-oriented programming, use of modules – all presented in a biological context) and presents some advanced topics of considerable interest in bioinformatics. The range of topics covered in Mastering Perl for Bioinformatics prepares the reader for enduring and emerging developments in critical areas of bioinformatics programming such as: * Gene finding * String alignment * Methods of data storage and retrieval (SML and databases) * Modeling of networks (graphs and Petri nets) * Graphics (Tk) * Parallelization * Interfacing with other programming languages * Statistics (PDL) * Protein structure determination * Biological models of computation (DNA Computers)Biologists and computer scientists who have conquered the basics of Perl and are ready to move even further in their mastery of this versatile language will appreciate the author’s well-balanced approach to applying Perl’s analytical abilities to the field of bioinformatics. Full of practical examples and real-world biological problem solving, this book is a must for any reader wanting to move beyond beginner level Perl in bioinformatics.