دانلود کتاب Reconstructing Evolution: New Mathematical and Computational Advances

ترجمه فارسی توضیحات (ترجمه ماشینی)

بازسازی تکامل: پیشرفت های جدید ریاضی و محاسباتی

تکامل فرآیند پیچیده‌ای است که در مقیاس‌های مختلف از توالی‌های DNA و پروتئین‌ها گرفته تا جمعیت گونه‌ها عمل می‌کند. درک و بازسازی تکامل در بسیاری از زیرشاخه های زیست شناسی از اهمیت زیادی برخوردار است. برای مثال، فیلوژنتیک و تکامل توالی در ژنومیک مقایسه ای، تلاش برای رمزگشایی ژنوم ها و اپیدمیولوژی مولکولی مرکزی است. فیلوژنتیک همچنین نقطه کانونی ابتکارات ارزیابی بین المللی تنوع زیستی در مقیاس بزرگ است، مانند پروژه “درخت زندگی”، که هدف آن ساختن درخت تکاملی برای همه گونه های موجود است. از زمان کار پیشگام در فیلوژنتیک در دهه 1960، مدل ها به طور فزاینده ای تبدیل شده اند. پیچیده برای توضیح پیچیدگی ذاتی تکامل. آنها به شدت بر ریاضیات متکی هستند و هدف آنها مدل سازی و تجزیه و تحلیل پدیده های بیولوژیکی مانند انتقال افقی ژن، ناهمگونی جهش، و فرآیندهای گونه زایی و انقراض است. این کتاب این مدل‌های اخیر، ارتباط بیولوژیکی، مبنای ریاضی، ویژگی‌های آن‌ها و الگوریتم‌هایی را برای استنتاج آنها از داده‌ها ارائه می‌کند. تعدادی از زیرشاخه های ریاضیات و علوم کامپیوتر درگیر هستند: ترکیبات، نظریه گراف، رشته شناسی، مدل های احتمال و مارکوف، نظریه اطلاعات، استنتاج آماری، روش های مونت کارلو، الگوریتم های پیوسته و گسسته. این کتاب از نشست ریاضیات تکامل و فیلوژنتیک ناشی شده است. در انستیتوی ریاضی هنری پوانکر، پاریس، در ژوئن 2005 و بر اساس گزارش‌های برجسته و پیشرفته ارائه شده توسط سخنرانان کنفرانس است. ده فصل – بر اساس پنج موضوع – یک مرور کلی از موضوعات کلیدی، از مفاهیم زیربنایی گرفته تا آخرین نتایج، که برخی از آنها در خط مقدم تحقیقات فعلی هستند، ارائه می دهد.

Reconstructing Evolution: New Mathematical and Computational Advances

Evolution is a complex process, acting at multiple scales, from DNA sequences and proteins to populations of species. Understanding and reconstructing evolution is of major importance in numerous subfields of biology. For example, phylogenetics and sequence evolution is central to comparative genomics, attempts to decipher genomes, and molecular epidemiology. Phylogenetics is also the focal point of large-scale international biodiversity assessment initiatives such as the ‘Tree of Life’ project, which aims to build the evolutionary tree for all extant species.Since the pioneering work in phylogenetics in the 1960s, models have become increasingly sophisticated to account for the inherent complexity of evolution. They rely heavily on mathematics and aim at modelling and analyzing biological phenomena such as horizontal gene transfer, heterogeneity of mutation, and speciation and extinction processes. This book presents these recent models, their biological relevance, their mathematical basis, their properties, and the algorithms to infer them from data. A number of subfields from mathematics and computer science are involved: combinatorics, graph theory, stringology, probabilistic and Markov models, information theory, statistical inference, Monte Carlo methods, continuous and discrete algorithmics.This book arises from the Mathematics of Evolution & Phylogenetics meeting at the Mathematical Institute Henri Poincare, Paris, in June 2005 and is based on the outstanding state-of-the-art reports presented by the conference speakers. Ten chapters – based around five themes – provide a detailed overview of key topics, from the underlying concepts to the latestresults, some of which are at the forefront of current research.